Die Serie A und die Serie B wurde in zwei regionale Gruppen eingeteilt. Ein Sieg brachte 2 Punkte, ein Remis 1 Punkt ein. Der Sieger jeder Gruppe qualifizierte sich für die jeweiligen Finalspiele. Der Sieger der Finalspiele der Serie A wird Schweizer Meister 1900/01.
Das Finale musste wiederholt werden, weil der Grasshopper Club Zürich im ersten Spiel einen nicht-qualifizierten Spieler eingesetzt hatte. Am 14. April 1901 gewann der Grasshopper Club Zürich gegen den FC Bern, womit sie Schweizer Meister 1901 wurden.