Nukleoside

Aufbau von Nukleotiden und Nukleosiden. Bei einem Nukleosid ist die 5′-OH-Gruppe der Pentose nicht mit einer Phosphatgruppe verestert. Über das C1′-Atom ist eine Base mit dieser Pentose verknüpft. Falls der Rest R eine Hydroxygruppe ist, liegt eine Ribose vor, bei einem Wasserstoffrest spricht man von einer Desoxyribose.

Nukleoside (auch Nucleoside) sind organische Moleküle, die aus einer Nukleobase und einer Pentose bestehen. In einer Zelle kommen verschiedene Nukleoside vor, die sich im Basen- oder Zuckeranteil unterscheiden. Sie enthalten im Unterschied zu den Nukleotiden von Nukleinsäuren (DNA oder RNA) keine Phosphatreste.

Grundtypen

Die fünf Grundtypen der Nukleoside bestehen entweder aus einer Purin- oder einer Pyrimidinbase. Wenn sie Bausteine einer RNA sind, ist die Pentose (ein Einfachzucker mit fünf C-Atomen) die Ribose, in der DNA liegt als Pentose die Desoxyribose vor. Deshalb nennt man die Bausteine der DNA genauer Desoxynukleoside, während Nukleoside im engeren Sinne die Bausteine der verschiedenen RNA-Formen sind. Die Verknüpfung von Base und Pentose erfolgt bei den Purin-Basen stets über das Stickstoffatom in Position 9, bei den Pyrimidin-Basen über das Stickstoffatom in Position 1 und das C1′-Atom des Zuckers.

Purin-Basen

NukleobaseNukleosidDesoxynukleosid
AdeninAdenosinDesoxyadenosin
AdeninAdenosin, ADesoxyadenosin, dA
GuaninGuanosinDesoxyguanosin
GuaninGuanosin, GDesoxyguanosin, dG

Anmerkung: Es ist jeweils nur eine der möglichen tautomeren Strukturen dargestellt.

Pyrimidin-Basen

NukleobaseNukleosidDesoxynukleosid
CytosinCytidinDesoxycytidin
CytosinCytidin, CDesoxycytidin, dC
Thymin5-MethyluridinDesoxythymidin
ThyminRibothymidin T[1] (= 5-Methyluridin)Desoxythymidin, dT
UracilUridinDesoxyuridin
UracilUridin, UDesoxyuridin, dU

Abwandlungen der Grundformen

Neben diesen Grundformen gibt es noch zahlreiche Modifikationen, die vor allem in den tRNAs und rRNAs zu finden sind.[2] Einige finden sich auch in der DNA.[3] Diese veränderten Nukleoside entstehen in der Regel erst nach der Transkription und dienen einer Feineinstellung von Struktur, Aktivität und Spezifität der Moleküle. Die meisten Modifikationen entstehen durch Methylierung.

Einen Überblick über die möglichen Abwandlungen soll die folgende Auswahl geben. Zum Vergleich sind die Grundformen ebenfalls angeführt:

Pyrimidin-Nukleoside

Pyrimidin-Nukleoside (Auswahl)
NameSymbolPyrimidin-GrundstrukturR1R2R3R4R5R6
CytidinCPyrimidin-GrundgerüstRibose=O–NH2
3-Methylcytidinm3CRibose=O–CH3–NH2
5-Methylcytidinm5CRibose / Desoxyribose=O–NH2–CH3
N4-Methylcytidinm4CRibose / Desoxyribose=O–NH–CH3
N4,N4-Dimethylcytidinm42CRibose=O–N(CH3)2
2′-O-MethylcytidinCm2′-O-Methyl-ribose=O–NH2
Isocytidin (synth.)iCRibose–NH2=O
Pseudocytidin (synth.)ΨC–H=O–NH2Ribose
Pseudoisocytidin (synth.)psiC–H–NH2=ORibose
2-Thiocytidins2CRibose=S–NH2
N4-Acetylcytidinac4CRibose=O–NH–CO–CH3
UridinURibose=O=O
3-Methyluridinm3URibose=O–CH3=O
2′-O-MethyluridinUm2′-O-Methyl-ribose=O=O
PseudouridinP, Ψ, Ψrd–H=O=ORibose
DihydrouridinD, UH2, UhRibose=O=O–H,–H–H,–H
5-Methoxyuridinmo5URibose=O=O–O–CH3
5-(Carboxyhydroxymethyl)-Uridinchm5URibose=O=O–CH(OH)–CO2CH3
5-Carboxymethylaminomethyl-Uridincmnm5URibose=O=O–CH2–NH–CH2–CO2CH3
5-Methylaminomethyl-Uridinmnm5URibose=O=O–CH2–NH–CH3
5-Methoxy-carbonylmethyl-Uridinmcm5URibose=O=O–CH2–CO2CH3
2-Thiouridins2URibose=S=O
4-Thiouridins4URibose=O=S
Ribothymidin (= 5-Methyluridin)T, m5URibose=O=O–CH3
DihydrothymidinDesoxyribose=O=O–H,–CH3–H,–H

Purin-Nukleoside

Purin-Nukleoside (Auswahl)
NameSymbolPurin-GrundstrukturR1R2R3R4R5R6R7R8R9
AdenosinAPurin-Grundgerüst–NH2Ribose
1-Methyladenosinm1A–CH3–NH2Ribose
2-Methyladenosinm2A–CH3–NH2Ribose
N6-Methyladenosinm6A–NH–CH3Ribose / Desoxyribose
N6,N6-Dimethyladenosinm62A–N(CH3)2Ribose
2′-O-MethyladenosinAm–NH22′-O-Methyl-ribose
InosinI=ORibose
1-Methylinosinm1I–CH3=ORibose
2′-O-MethylinosinIm=O2′-O-Methyl-ribose
GuanosinG–NH2=ORibose
1-Methylguanosinm1G–CH3–NH2=ORibose
7+-Methylguanosinm7G–NH2=O–CH3Ribose
N2-Methylguanosinm2G–NH–CH3=ORibose
N2,N2-Dimethylguanosinm22G–N(CH3)2=ORibose
2′-O-MethylguanosinGm–NH2=O2′-O-Methyl-ribose
Isoguanosin (synth.)iG=O–NH2Ribose

Hypermodifizierte Nukleoside und mit verändertem Basengrundgerüst

QueuosinArchaeosin
Queuosin (Q, obiges Bild)
β-D-Galactosyl-queuosin (galQ)
β-D-Mannosyl-queuosin (manQ)
Archaeosin (G*, kommt nur in Archaeen vor)
2′-O-RibosyladenosinphosphatWybutosin
2′-O-Ribosyladenosinphosphat (Ar(p), rAMP)
nur in Eukaryoten gefunden
Wybutosin (Y, yW; obiges Bild)
Wyosin (Wyo, imG)
N6-ThreonylcarbamoyladenosinLysidin
N6-Threonylcarbamoyladenosin (t6A)Lysidin (k2C)

Variationen der Pentosen

Nukleobase(Ribosyl)NukleosidDesoxynukleosidArabinosylnukleosid(Methylribosyl)Nukleosid
CytosinCytidinDesoxycytidinCytarabin2'-O-Methylcytidin
CytosinCytidin, CDesoxycytidin, dCCytarabin, araC2′-O-Methylcytidin, Cm

Physiologie

Wird die Hydroxygruppe des C-5-Atoms der Pentose eines Nukleosids mit Phosphat verestert, entsteht das entsprechende Nukleotid. Je nach Anzahl der Phosphat-Reste spricht man von Mono-, Di- und Triphosphaten. Aus der zentralen Bedeutung der Nukleotide ergibt sich die gleiche Bedeutung für die entsprechenden Nukleoside, da sie als Baustein der Nukleotide in diese umgewandelt werden können.

Die Nukleoside stehen durch Abspaltung der letzten Phosphatgruppe in den Nukleotiden mittels Hydrolyse, mithilfe von Nukleotidase-Enzymen in allen Lebewesen zur Verfügung. Weiterhin kann Inosin aus Adenosin mittels der AMP-Desaminase oder der Guanin-Desaminase synthetisiert werden. Xanthosin ist entsprechend nicht nur durch Hydrolyse von XMP erhältlich, sondern auch aus Guanosin mittels der Guanosin-Desaminase.

Der Abbau erfolgt über Nukleosidasen zur Nukleobase und bei Purinen über Xanthin zur Harnsäure bzw. bei Pyrimidinen zum Alanin oder zur 2-Aminobuttersäure.

Nukleosid-Analoga

Nukleosid-Analoga spielen vor allem in der antiretroviralen Therapie eine große Rolle. Eine Reihe moderner Virostatika enthalten diese Substanzen. Wohl am besten bekannt ist der Wirkstoff Aciclovir, der häufig gegen Herpes-simplex-Viren (HSV-1 und -2) eingesetzt wird. Weiterhin verbreitet ist Ganciclovir, das genau wie Aciclovir ein Guanosin-Analogon ist, und spezifisch die Replikation von CMV unterdrückt. Ein weiteres wichtiges Einsatzgebiet ist die Krebstherapie. So werden 5-Fluorouracil und Cytarabin als Zytostatika eingesetzt.

Einzelnachweise

  1. Löffler, Petrides, Heinrich: Biochemie und Pathobiochemie. 8. Auflage. Springer, Heidelberg 2007, ISBN 978-3-540-32680-9.
  2. Patrick A. Limbach, Pamela F. Crain, James A. McCloskey: „Summary: the modified nucleosides of RNA“, Nucleic Acids Research, 1994, 22 (12), S. 2183–2196 (doi:10.1093/nar/22.12.2183, PMC 523672 (freier Volltext), PMID 7518580).
  3. Melanie Ehrlich, Miguel A. Gama-Sosa, Laura H. Carreira, Lars G. Ljungdahl, Kenneth C. Kuo, Charles W. Gehrke: „DNA methylation in thermophilic bacteria: N4-methylcytosine, 5-methylcytosine, and N6-methyladenine“, Nucleic Acids Research, 1985, 13 (4), S. 1399–1412 (doi:10.1093/nar/13.4.1399, PMC 341080 (freier Volltext), PMID 4000939).
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