Am EHF-Europapokal der Pokalsieger 2005/06 nahmen 32 Handball-Vereinsmannschaften aus 27 Ländern teil. Diese qualifizierten sich in der vorangegangenen Saison in ihren Heimatländern im Pokalwettbewerb für den Europapokal oder kamen als Drittplatzierte der Gruppenphase aus der Champions League 2005/06 dazu. Bei der 30. Austragung des Pokalsiegerwettbewerbs konnte ŽRK Budućnost MONET Podgorica zum zweiten Mal nach 1985 den Pokal gewinnen.

Da die Europäische Handballföderation die Rundenbezeichnungen aller Clubwettbewerbe vereinheitlichte und das Starterfeld im Cup der Pokalsieger relativ klein war, begann dieser erst mit den Spielen der 2. Runde. Die Hinspiele der 2. Runde fanden zwischen dem 1. und 8. Oktober und die Rückspiele zwischen dem 2. und 9. Oktober 2005 statt.

	Gesamt		Hinspiel	Rückspiel
MKS Zagłębie Lubin  Polen	73:39	Nordmazedonien Eurostandard GJ.P. Skopje	30:16	43:23
ZMC Amicitia Zürich  Schweiz	48:37	Belgien Sporting Neerpelt	25:19	23:18 ⁠(1)
Sola HK  Norwegen	90:26	Zypern 1960 SPES Kefalovrysos	53:11	37:15
ASSOMADA Carnaxide  Portugal	47:81	Serbien und Montenegro ŽRK Naisa Niš	22:38	25:43
KH Vicianet Mitrovice	29:85	Deutschland TSV Bayer 04 Leverkusen	13:44⁠(2)	16:41
S.D. Itxako Estella  Spanien	83:15	Israel Hapoel Kiryat Ono	40:10	43:50⁠(3)
UMF Stjarnan  Island	66:67	Turkei Anadolu University S.C.	39:34	27:33⁠(4)
Kuban Krasnodar  Russland	72:43	Slowenien RK Celeia Žalec	38:27	34:16⁠(5)
Galychanka Lviv  Ukraine	50:54	Griechenland A.C. Ormi Patras	26:27⁠(6)	24:27
CS Rapid CFR Bukarest  Rumänien	97:33	Moldau Republik C.S. Baracuda Handball	52:13	45:20⁠(7)
Váci NKSE  Ungarn	60:52	Slowakei ŠKP Banská Bystrica	33:24	27:28
ZV McDonald’s Wiener Neustadt  Osterreich	51:41	Niederlande Zeeman Vastgoed SEW	29:21	22:20

Durch ein Freilos zogen RK Lokomotiva Zagreb, Horsens HK, ESBF Besançon und Gjerpen IF Skien direkt in die 3. Runde ein.

Die Hinspiele der 3. Runde fanden vom 7. und 14. Januar und die Rückspiele am 14. und 15. Januar 2006 statt.

	Gesamt		Hinspiel	Rückspiel
TSV Bayer 04 Leverkusen  Deutschland	75:43	Turkei Anadolu University S.C.	34:21⁠(8)	41:22⁠(8)
ZMC Amicitia Zürich  Schweiz	48:55	Rumänien CS Rapid CFR Bukarest	26:29	22:26⁠(9)
MKS Zagłębie Lubin  Polen	55:60	Danemark Horsens HK	28:28	27:32
Váci NKSE  Ungarn	56:52	Serbien und Montenegro ŽRK Naisa Niš	32:26	24:26
Gjerpen IF Skien  Norwegen	65:60	Osterreich ZV McDonald’s Wiener Neustadt	36:31	29:29
A.C. Ormi Patras  Griechenland	51:60	Frankreich ESBF Besançon	26:26	25:34
Sola HK  Norwegen	49:55	Russland Kuban Krasnodar	25:30⁠(10)	24:25
RK Lokomotiva Zagreb  Kroatien	38:40	Spanien S.D. Itxako Estella	24:17	14:23

In der 4. Runde fanden die Hinspiele vom 12. bis 18. Februar und die Rückspiele am 18. und 19. Februar 2006 statt.

	Gesamt		Hinspiel	Rückspiel
Kuban Krasnodar  Russland	44:48	Spanien S.D. Itxako Estella	27:19	17:29
CS Rapid CFR Bukarest  Rumänien	50:55	Frankreich ESBF Besançon	25:29⁠(11)	25:26
TSV Bayer 04 Leverkusen  Deutschland	57:55	Danemark Horsens HK	26:24	31:31
Gjerpen IF Skien  Norwegen	64:48	Ungarn Váci NKSE	37:23	27:25

Im Viertelfinale kamen aus der Champions League die dort ausgeschiedenen vier Drittplatzierten der Gruppenphase dazu. Die Hinspiele fanden am 11. und 12. März und die Rückspiele am 18. und 19. März 2006 statt.

	Gesamt		Hinspiel	Rückspiel
Gjerpen IF Skien  Norwegen	61:60	Ungarn Dunaferr NK	29:28	32:32
S.D. Itxako Estella  Spanien	36:49	Norwegen Larvik HK	17:18	19:31
TSV Bayer 04 Leverkusen  Deutschland	44:47	Serbien und Montenegro ŽRK Budućnost MONET Podgorica	21:18	23:29
Győri ETO KC  Ungarn	64:57	Frankreich ESBF Besançon	34:24	30:33

Im Halbfinale fanden die Hinspiele am 15. April und die Rückspiele am 22. April 2006 statt.

	Gesamt		Hinspiel	Rückspiel
Gjerpen IF Skien  Norwegen	53:65	Serbien und Montenegro ŽRK Budućnost MONET Podgorica	24:28	29:37
Győri ETO KC  Ungarn	55:51	Norwegen Larvik HK	33:28	22:23

Das Hinspiel fand am 13. Mai 2006 in Sportzentrum Morača von Podgorica und das Rückspiel am 20. Mai 2006 in der Magvassy Mihály Sporthalle von Győr statt.

	Gesamt		Hinspiel	Rückspiel
ŽRK Budućnost MONET Podgorica  Serbien und Montenegro	51:48	Ungarn Győri ETO KC	25:25	26:23

• 2005/06 Women's Cup Winners' Cup. Europäische Handballföderation, abgerufen am 16. März 2012 (englisch). 
• CWC Frauen 2006 auf Todor66.com