Der Spielbeginn des Teams begann im September 1906, als der neue Universitätscampus in Gainesville eröffnete. 1912 traten die Gators dann der Southern Intercollegiate Athletic Association (SIAA) bei, an der sie bis 1922, als sie sich der Southern Conference anschlossen, teilnahmen. Allerdings waren die Gators auch in dieser nicht lange Mitglied. 1933 traten sie der neugegründeten Southeastern Conference bei, deren Mitglied sie bis heute sind.