RE 9 steht für folgende Bahnlinien in Deutschland:

• Regional-Express zwischen Rostock und Sassnitz / Ostseebad Binz, siehe Liste der Eisenbahnlinien in Mecklenburg-Vorpommern #Regional-Express
• Regional-Express zwischen Bremerhaven-Lehe und Osnabrück, siehe Nahverkehr in Bremen #Regional-Express und Liste der SPNV-Linien in Niedersachsen
• Regional-Express zwischen Halle und Kassel, siehe Liste der Eisenbahnlinien in Sachsen-Anhalt #RE 9, Liste der Eisenbahnlinien in Thüringen #RE 9 und Liste der SPNV-Linien im Nordhessischen Verkehrsverbund #Regionalverkehr
• Rhein-Sieg-Express zwischen Aachen und Siegen
• Regional-Express zwischen Eltville und Frankfurt, siehe Liste der Eisenbahnlinien im Rhein-Main-Verkehrsverbund #SPNV-Linien im Rhein-Main-Verkehrsverbund
• Regional-Express zwischen München und Ulm, siehe Liste der SPNV-Linien in Bayern #Linien 9, 90–99 (Süd)