Die deutsche Fußballmeisterschaft der A-Junioren 1999/2000 gewann Bayer 04 Leverkusen. Im Endspiel in der Leverkusener BayArena siegte Bayer 04 am 2. Juli 2000 mit 4:2 gegen Werder Bremen.

An der Endrunde zur deutschen A-Jugendmeisterschaft nahmen folgende Mannschaften teil:

•   Werder Bremen (Meister Regionalliga Nord)

•   Hannover 96 (Vize-Meister Regionalliga Nord)

•   Tennis Borussia Berlin (Meister Regionalliga Nordost)

•   Bayer 04 Leverkusen (Meister Regionalliga West)

•   FC Schalke 04 (Vize-Meister Regionalliga West)

•   1. FC Kaiserslautern (Meister Regionalliga Südwest)

•   VfB Stuttgart (Meister Regionalliga Süd)

•   FC Bayern München (Vize-Meister Regionalliga Süd)

Bayer 04 Leverkusen		Werder Bremen
	Sonntag, 2. Juli 2000 um 11:00 Uhr in Leverkusen (BayArena) Ergebnis: 4:2 (3:1) Zuschauer: 7.500 Schiedsrichter: Nicht bekannt
	Tom Starke – Nenad Lazarevic, Mile Božić, Nico Reckert, Petr Čoupek (85. Stefan Bungart) – Nasir El Kasmi (63. Landon Donovan), Michael Habljak, Tim Jerat – Hüzeyfe Doğan, Thorsten Burkhardt (71. Fabian Ewertz), Felix Bably Cheftrainer: Thomas Hörster	Tim Hashagen – Hannes Wilking, Dennis Votava, Simon Knipper, Heinrich Büntemeyer – Heiner Backhaus (62. Mario Neunaber), Benjamin Titz (54. Hüseyin Altindag), Christian Schulz (46. Andre Möller), Simon Rolfes – Ahmet Kuru, Joey Di Iorio Cheftrainer: Axel Plaat
	1:1 Burkhardt (22.) 2:1 Doğan (42.) 3:1 Burkhardt (45.) 4:1 El Kasmi (58.)	0:1 Di Iorio (8.) 4:2 Rolfes (68.)