Als Kommission Santer wird die Europäische Kommission unter Kommissionspräsident Jacques Santer bezeichnet, die von 1995 bis 1999 im Amt war. Sie folgte der Kommission Delors III nach. Gegen Ende ihrer Amtszeit wurde die Kommission Santer von einem Korruptionsskandal um Édith Cresson erschüttert. Nachdem das Europäische Parlament mit einem Misstrauensantrag gedroht hatte, trat die Kommission am 15. März 1999 geschlossen zurück. In der danach gebildeten Übergangskommission Marín blieben allerdings Mitglieder und Ressortverteilung identisch, lediglich der Kommissionspräsident Santer und der bisherige Vizepräsident Manuel Marín tauschten die Posten. Erst für die Kommission Prodi, die ihr Amt Ende 1999 antrat, wurden neue Kommissionsmitglieder ernannt.

Ressort	Kommissar	Mitgliedstaat	nationale Partei	Europapartei
Präsident	Jacques Santer	Luxemburg Luxemburg	CSV	EVP
Vizepräsident, Handel	Leon Brittan	Vereinigtes Konigreich Vereinigtes Königreich	Conservative	ED
Vizepräsident, Beziehungen zum Mittelmeerraum, Lateinamerika und mittleren Osten	Manuel Marín	Spanien Spanien	PSOE	SPE
Industrie und Informations- und Telekommunikationstechnologie	Martin Bangemann	Deutschland Deutschland	FDP	ELDR
Wettbewerb	Karel Van Miert	Belgien Belgien	PS	SPE
Außenpolitik	Hans van den Broek	Niederlande Niederlande	CDA	EVP
Beziehungen zu den Staaten in Afrika, im karibischen Raum und im Pazifischen Ozean (AKP) sowie zu Südafrika, einschließlich Fragen der Entwicklungshilfe	João de Deus Pinheiro	Portugal Portugal	PSD	EVP
Beschäftigung und soziale Angelegenheiten, Beziehungen zum Wirtschafts- und Sozialausschuss	Pádraig Flynn	Irland Irland	Fianna Fáil	–
Energie, Euratom und Verkehr	Marcelino Oreja Aguirre	Spanien Spanien	PP	EVP
Einwanderungsfragen sowie Inneres und Justiz, Beziehungen zum Bürgerbeauftragten, Finanzkontrolle, Betrugsbekämpfung	Anita Gradin	Schweden Schweden	SAP	SPE
Wissenschaft, Forschung und Entwicklung	Édith Cresson	Frankreich Frankreich	PS	SPE
Umwelt und nukleare Sicherheit	Ritt Bjerregaard	Danemark Dänemark	SD	SPE
Beziehungen zum Ausschuss der Regionen, Regionalpolitik, Kohäsionsfonds	Monika Wulf-Mathies	Deutschland Deutschland	SPD	SPE
Verkehr	Neil Kinnock	Vereinigtes Konigreich Vereinigtes Königreich	Labour	SPE
Binnenmarkt, Steuern und Zollunion	Mario Monti	Italien Italien	parteilos	parteilos
Landwirtschaft und ländliche Entwicklung	Franz Fischler	Osterreich Österreich	ÖVP	EVP
Fischerei, Verbraucherpolitik und ECHO	Emma Bonino	Italien Italien	PR	–
Finanzen, Wirtschaft, Währungsangelegenheiten und Eurostat	Yves-Thibault de Silguy	Frankreich Frankreich	parteilos	parteilos
Haushalt, Personal und Verwaltung	Erkki Liikanen	Finnland Finnland	SDP	SPE
Energie, Euratom, Mittel- und Kleinbetriebe, Tourismus	Christos Papoutsis	Griechenland Griechenland	PASOK	SPE