Joachim Werner ist der Name folgender Personen:

• Joachim Werner (1909–1994), deutscher Archäologe
• Joachim Werner (Ruderer) (1939–2010), deutscher Ruderer
• Joachim Werner (Fußballspieler, April 1939) (* 1939), deutscher Fußballspieler (Eintracht Braunschweig)
• Joachim Werner (Fußballspieler, November 1939) (* 1939), deutscher Fußballspieler (Arminia Bielefeld, Westfalia Herne)