Der EHF-City-Cup der Frauen 1998/99 war die 6. Auflage des Pokalwettbewerbs für europäische Handball-Vereinsmannschaften, der jährlich von der Europäischen Handballföderation organisiert wurde.

Aufgrund der Bombardierung von Serbien konnte das Finale mit serbischer Beteiligung nicht ausgetragen werden.

Mannschaft 1	Mannschaft 2	Spiel 1	Spiel 2
1. Runde
Osterreich Schulhandball Mödling	Jugoslawien Bundesrepublik 1992 ŽORK Napredak Kruševac	21:40	20:50
Turkei PTT Türk Telekom Spor Kulübü	Griechenland Gymnastiki Enosi Verias	34:26	33:29
Ukraine Awtomobylyst Browary	Belarus Universität Homel	45:24	30:26
Bosnien und Herzegowina ŽRK Željeznicar Hadžići	Mazedonien 1991 RK Skopje	23:14	22:23
Spanien Bera-Bera San Sebastian	Slowenien M. Degro Piran	31:21	23:22
Litauen Panevėžio Lėvuo	Schweiz ZMC Amicitia Zürich	19:15	19:23
Kroatien ŽRK Split Kaltenberg	Polen EB Start Elbląg	25:20	16:19
Niederlande Van Riet Nieuwegein	Italien EOS Siracusa	32:18	26:19
Danemark Frederikshavn FI (Freilos)
Danemark GOG Gudme (Freilos)
Deutschland Frankfurter HC (Freilos)
Frankreich Handball Cercle Nîmes (Freilos)
Norwegen Nordstrand Oslo (Freilos)
Rumänien Oțelul Galați (Freilos)
Russland SC A-ELITA Krasnador (Freilos)
Ungarn Vasas Budapest (Freilos)
Achtelfinale
Jugoslawien Bundesrepublik 1992 ŽORK Napredak Kruševac	Russland SC A-ELITA Krasnador	39:26	24:31
Danemark Frederikshavn FI	Turkei PTT Türk Telekom Spor Kulübü	37:34	40:24
Rumänien Oțelul Galați	Ukraine Awtomobylyst Browary	31:28	32:34
Ungarn Vasas Budapest	Bosnien und Herzegowina ŽRK Željeznicar Hadžići	29:14	25:26
Norwegen Nordstrand Oslo	Spanien Bera-Bera San Sebastian	31:20	23:22
Frankreich Handball Cercle Nîmes	Litauen Panevėžio Lėvuo	26:14	19:18
Danemark GOG Gudme	Kroatien ŽRK Split Kaltenberg	21:25	22:22
Deutschland Frankfurter HC	Niederlande Van Riet Nieuwegein	31:28	18:26
Viertelfinale
Danemark Frederikshavn FI	Jugoslawien Bundesrepublik 1992 ŽORK Napredak Kruševac	28:23	20:28
Ungarn Vasas Budapest	Rumänien Oțelul Galați	21:20	20:24
Frankreich Handball Cercle Nimes	Norwegen Nordstrand Oslo	13:14	23:16
Kroatien ŽRK Split Kaltenberg	Niederlande Van Riet Nieuwegein	24:21	12:19
Halbfinale
Rumänien Oțelul Galați	Jugoslawien Bundesrepublik 1992 ŽORK Napredak Kruševac	30:27	20:24
Niederlande Van Riet Nieuwegein	Frankreich Handball Cercle Nîmes	24:21	22:17
FINALE nicht ausgetragen wegen Bombardierung Serbiens
Jugoslawien Bundesrepublik 1992 ŽORK Napredak Kruševac	Niederlande Van Riet Nieuwegein	-:-	-:-

• EHF-Pokal der Frauen 1998/99
• EHF-Europapokal der Pokalsieger der Frauen 1998/99
• Liste der Handball-Europapokalsieger der Frauen
• Liste der Handball-Europapokalsieger der Männer

• http://todor66.com/handball/Euro_Cups/Women_City_1999.html