Die Saison 2006/07 der Oberliga Hessen war die 29. Spielzeit der Fußball-Oberliga Hessen und die 13. als vierthöchste Spielklasse in Deutschland. Die Meisterschaft und den Aufstieg in die Regionalliga sicherte sich der FSV Frankfurt mit 22 Punkten Vorsprung auf Viktoria Aschaffenburg.
Der FSV 1926 Steinbach spielte ab der folgenden Spielzeit unter dem Namen FSV 1926 Fernwald. Die Oberliga Hessen bestand in der folgenden Saison wieder aus 18 Mannschaften.
Die Zweitmannschaften von Erst- und Zweitligisten durften nur Spieler einsetzen, die während des gesamten Spieljahres (1. Juli bis 30. Juni) nicht älter als 23 Jahre waren (U23). Somit waren in dieser Saison grundsätzlich nur Spieler spielberechtigt, die am oder nach dem 1. Juli 1983 geboren wurden. Darüber hinaus durften sich drei ältere Spieler gleichzeitig im Spiel befinden.
Für den verbleibenden freien Platz in der Oberliga spielten die zwei Vizemeister der Landesliga-Staffeln Nord und Süd sowie der Tabellendritte der Staffel Mitte eine Aufstiegsrunde. Der Gruppensieger Rot-Weiss Frankfurt stieg direkt auf.