Dies ist eine Liste der Universitäten und Hochschulen in Estland. In Estland gibt es 12 anerkannte Universitäten, davon 7 staatliche und 5 private Universitäten sowie 26 weitere Hochschulen:

Platz	Universität	Studentenzahl	Gründungsjahr
1	Universität Tartu	ca. 15.000	1632
2	Estnische Universität der Umweltwissenschaften, Tartu (bis 2005: Estnische Agraruniversität)	ca. 5.000	1848
3	Estnische Kunstakademie, Tallinn	ca. 1.200	1914
4	Estnische Musikakademie, Tallinn	keine Angaben	1918
5	Technische Universität Tallinn	ca. 10.000	1918
6	Estnische Marineakademie, Tallinn	ca. 1.000	1991
7	Universität Tallinn (vormals Pädagogische Universität Tallinn)	ca. 7.000	2005

• Akademie Nord, Tallinn
• International University Audentes, Tallinn (vormals Concordia-International-Universität)
• Euro-Universität, Tallinn
• Estnisches Theologisches Institut der Evangelisch-Lutherischen Kirche, Tallinn
• Estonian Business School, Tallinn

• Technische Hochschule Tallinn
• Estnische Verteidigungsakademie
• Estnisches Institut für Menschenrechte
• Estnisches Theologisches Institut der Evangelisch-Lutherischen Kirche

• Estnische Akademie der Wissenschaften, Tallinn

• Estnisches Ministerium für Bildung und Forschung
• Vollständige Liste der Universitäten und Hochschulen in Estland durch die Estnische Hochschulrektorenkonferenz
• DAAD in Estland
• Swissbaltic