Werner Ebert ist der Name folgender Personen:

• Werner Ebert (Pilot) (1920–2018), deutscher Pilot
• Werner Ebert (Entomologe) (1928–2015), deutscher Entomologe, Forstwissenschaftler und Hochschullehrer
• Werner Ebert (Mediziner) (1933–2014), deutscher Pathologe und Hochschullehrer