Johann Peter Müller ist der Name folgender Personen:

• Johann Peter Müller (Theologe, 1709) (1709–1796), deutsch-amerikanischer Theologe
• Johann Peter Müller (1791–1877), deutscher Lehrer, Pfarrer und Komponist, siehe Peter Müller (Komponist)
• Johann Peter Andreas Müller (1744–1821), deutscher Theologe

Siehe auch:

• Johannes Müller (Mediziner) (Johannes Peter Müller; 1801–1858), deutscher Mediziner