Am 17. Juni 983 wurde das Dorf erstmals urkundlich erwähnt.<ref>[[Wolfgang Kahl (Autor)|Wolfgang Kahl]]: ''Ersterwähnung Thüringer Städte und Dörfer. Ein Handbuch.'' Verlag Rockstuhl, Bad Langensalza, 2010, ISBN 978-3-86777-202-0,S.37</ref> 1122 trat der [[Freie]] Heinrich von Bonnrode seinen ganzen Besitz mit [[Kapelle (Kirchenbau)|Kapelle]] und Zubehör dem [[Kloster Reinhardsbrunn]] ab. 1150 wurde das Anwesen ein [[Benediktiner]]-[[Kloster|Nonnenkloster]]. 1525 besetzten Bauern das Kloster und verjagten aus Gründen der Ausbeutung die [[Nonne]]n. Es wurde, wie so oft, alles verwüstet. 1539 wurde das Kloster aufgehoben. Die Propstei fiel dem [[Herzog von Sachsen]] zu. 1540 verpachtete er an Bewirtschafter, die wieder alles ruinierten. 1900 wurde Bonnrode ein [[Rittergut]]. Es wurde von zwei Familien bewirtschaftet. Am 3. März 1958 wurden das [[Gutshof|Gut]] und die [[Landwirtschaftliche Produktionsgenossenschaft|LPG]] ''Goldborn'' gebildet. Später verfielen auch die Gebäude, sodass 1951 alles an einen Öko-Bauern verkauft wurde. Es wurde alles saniert und eine Obstplantage angelegt. Nach erneutem Leerstand wurde der Grund und Boden und das Anwesen nach Oberbösa verkauft. Am 12. September 2004 kamen viele Gäste zur Neueröffnung des Gutes. Am 25. September 2004 erfolgte die Gründung des ''Vereins Klostergut Bonnrode e.V.''<ref>[http://www.kloster-bonnrode.de/ www.kloster-bonnrode.de] Abgerufen am 12. Juli 2012</ref>