Die Verbandsliga Schleswig-Holstein wurde zur Saison 1988/89 das 42. Mal ausgetragen und bildete den Unterbau der drittklassigen Oberliga Nord. Die beiden erstplatzierten Mannschaften durften an der Aufstiegsrunde zur Oberliga Nord teilnehmen. Die Mannschaften auf den drei letzten Plätzen mussten in die Landesliga absteigen.

TSV Büsum Eutin 08 TSB Flensburg Blau-Weiß Friedrichstadt Heider SV Itzehoer SV TSV Kappeln VfB Kiel, FC Kilia Kiel, SV Ellerbek VfB Lübeck, 1. FC Phönix Lübeck VfR Neumünster TSV Plön TSV Pansdorf NTSV Strand 08

Vereine der Verbandsliga Schleswig-Holstein 1988/89

Im Vergleich zur Saison 1987/88 veränderte sich die Zusammensetzung der Liga folgendermaßen: Der TuS Hoisdorf war in die Oberliga Nord auf-, während keine Mannschaft aus Schleswig-Holstein aus der Oberliga Nord abgestiegen war. Die drei Absteiger hatten die Verbandsliga verlassen und wurden durch die vier Aufsteiger NTSV Strand 08 (Wiederaufstieg nach zwei Jahren), SV Ellerbek, TSV Kappeln und TSV Büsum (alle drei erstmals in der höchsten Amateurliga Schleswig-Holsteins) ersetzt.

Die Meisterschaft und Teilnahme an der Aufstiegsrunde sicherte sich der VfB Lübeck. Als Zweitplatzierter durfte der VfB Kiel ebenfalls teilnehmen. Lübeck beendete seine Gruppe auf dem zweiten Platz hinter dem TuS Esens und Kiel musste sich in seiner Gruppe lediglich der Amateurmannschaft des Hamburger SV geschlagen geben, wodurch beide den Aufstieg verpassten. Der SV Ellerbek musste die Verbandsliga nach einer Saison wieder verlassen, der Itzehoer SV und der 1. FC Phönix Lübeck mussten beide erstmals aus der höchsten Amateurliga Schleswig-Holsteins absteigen.

• Deutscher Sportclub für Fußball-Statistiken: Fußball in Norddeutschland 1974–2004. 2. Auflage. S. 97. 

• Tabellen der Verbandsliga Schleswig-Holstein 1988/89 im deutschen Fußball-Archiv